Гаметофит кукушкина льна от сфагнума отличается тем, что у кук.льна бывают мужские и женские растения (на мужских образуются антеридии, на женских архегонии), а у сфагнума и антеридии, и архегонии развиваются на одном растении. У сфагнума стебель ветвится, а у кук.льна нет. У сфагнума нет ризоидов, у кук.льна есть. У листьев кук.льна есть жилка, у сфагнума нет жилок. У кук.льна на коробочке на ножке есть покрывальце, у сфагнума нет. Коробочка на ножке сфагнума шарообразная, а у кук.льна похожа на кукушку.
