В недрах региона находятся большие запасы природного газа (восточная часть Туркменистана и запад Узбекистана, небольшие месторождения есть в Киргизии). Нефтеносная прилегающая территория Каспия. Угольные ресурсы Средней Азии небольшие, всего их сосредоточено в Киргизии и Таджикистане. Рудные залежи представлены месторождениями полиметаллов и редких руд (Узбекистан и Таджикистан), сурьмы и ртути (Киргизия). Алюминиевого сырья (бокситы, алунит, нефелины) исследовано в Фергане (Узбекистан) и Гисарський долине (Таджикистан).