Первые шаги в изучении клетки были сделаны при помощи светового микроскопа. С дальнейшим развитием микроскопа и других инструментов исследования клетки, объем знаний о клетке увеличивался. Применение электронного микроскопа позволило детально изучить все структурные составляющие клетки (органоиды). Из этого можно сделать вывод, что сдерживающим фактором для развития цитологии долгое время являлся уровень развития инструментов исследования, в частности микроскопа.