В процессе гаструляции происходит впячивание вегетативного полюса (нижней части бластулы) в первичную полость тела. У многоклеточных имеется третий слой – мезодерма, который появляется последним в процессе гаструляции, между экто- и энтодермой. Тогда зародыш и становится трехслойным.