Как вы думаете, почему оглавление в реферате помещают в начало документа, а во многих книгах — в конец?

Потому что при чтении реферата сперва нужно представить его структуру, т,е. разместить оглавление в начале. В книгах такого не требуется, если читателю необходимо будет что-то найти, он обратится в конец к ее содержанию.