Расправы над религиозными меньшинствами уничтожили огромный пласт культуры Испании, который нёс наследие не только Средних веков, но, отчасти, ещё и античных времён. Кроме того, эти меры нанесли удар по хозяйству страны. В лице иудеев и марранов (бывших иудеев, принявших крещение) были изгнаны ремесленники и финансисты, нехватка которых сразу стала ощущаться. Мориски (бывшие мусульмане, принявшие крещение) были квалифицированными земледельцами, хранившие опыт многих поколений в этом деле, отчасти ещё римское наследие. Их изгнание ударило по сельскому хозяйству.