Они являются кормом для водных животных: пресноводных рачков (дафний, циклопов), рыб и др. Многие протисты являются «санитарами» загрязненных водоемов, потому что активно поглощают из воды органические вещества. Некоторые протисты являются паразитами других организмов. Они вызывают многие заболевания человека (например, дизентерию, малярию), а также болезни животных и растений.
