Восточно-Африканская рифтовая зона образовалась в результате внутренних тектонических процессов – поднятия и расхождения отдельных блоков платформы. Земная кора разломалась, образовались горсты и грабены. Впадины постепенно заполнялись водами и формировались тектонические озера.