Результаты отличаются, потому что скрещивание проводилось с горошинами, имеющие разный генетический набор. В первом случае скрещивание проводилось только между гибридами первого поколения (F1). Они несут задатки зеленой окраски, что и проявилось при скрещивании. Во втором случае скрещивание проводилось между гибридом первого поколения (F1) и родителем (Р), обладающим только задатками зелёной окраски горошин. Здесь вероятность появления зеленых горошин возрастают, потому что один гебрид (есть скрытые задатки зеленой окраски горошин) и родитель (чистая линия, обладающая только задатками зелёной окраски горошин).
Мендель провел два опыта: 1. Скредивание гебридов первого поколения, где проявляются скрытые задатки зеленой окраски горошин у малого количества семян. 2. Возвратное скрещивание между гибридом первого поколения (Fi) и родителем (Р). В первом же поколении от такого скрещивания обнаружилось расщепление, причем жёлтых и зелёных горошин получилось примерно поровну. Таким образом, в обоих случаях сравнения подстановка «жёлтых» гибридов Fi вместо «жёлтых» растений чистой линии увеличивало долю «зелёных» потомков. Это доказывает гипотезу о скрытых наследственных задатках зелёной окраски горошин у гибридов первого поколения (Fj), которые получены от родителей и могут передаваться потомству.
