Для чего необходимо поочередное обращение к дискам на этапе загрузки компьютера? почему не указывают однозначно, какой именно диск является системным?

Ну это не обязательно, диск C является системным, а загрузки происходят на выбранный диск, если у тебя 1 файл устанавливается на 2 диска сразу, то сделай дефрагментацию диска.