Постепенно к 15 в. начинаются неурядицы внутри православного духовенства. В центре церковных споров стоял вопрос о церковных богатствах. Появились две группы церковных деятелей, которые занимали противоположные позиции по этому вопросу. Это Нестяжатели, во главе с Нилом Сороским, и иосифляне во главе с Иосифом Волоцким. Нестяжатели выступали за ликвидацию монастырского землевладения и считали, что монахи должны вести аскетических образ жизни и питаться только плодами своего труда. Другие церковные деятели, которые получили названия иосифляне, защищали монастырские владения. Они считали, что церковь должна иметь материальные средства, для того чтобы распространять свои идеи, заниматься благотворительностью и просвещением.
Ограничивалась власть наместников и волостелей, расширялись права служивого сословия. В частности, запрещался переход служилых людей в кабальное холопство, более детально регламентировались взаимоотношения между феодалами и зависимыми крестьянами, законодательно установлен Юрьев день, закон предоставлял крестьянским общинам право самоуправления, раскладки податей и надзора за порядком, подтверждалось право свободного перехода крестьян, Судебник защищал честь любого члена общества, однако штрафы за бесчестье различались.