При горении этих газов в хлоре(по отдельности, конечно) пламя водорода остается синевато-прозрачным, как при горении в воздухе, а пламя метана - яркое, коптящее. Если при горении на воздухе в нижнюю часть пламени опустить холодный предмет, то в пламени метана на этом предмете осядет сажа (но не всегда). Шарики, наполненные водородом, легче, чем наполненные метаном. Ну, и в бытовой среде(на кухне, к примеру) в метан добавляют вонючие соединения, чтобы можно было найти протечку.