Может ли следователь сперва возбудить уголовное дело по факту обнаружения трупа с признаками насильственной смерти (странгуляционная борозда на шее), но после получения заключения суд-мед экспертизы и проведения ряда других следственных действий прекратить дело за отсутствием события преступления, по поводу которого оно было возбуждено. в связи с тем, что он пришел к выводу о том, что гражданин повесился сам? не надо ли делать в этом случае патологоанатомическое вскрытие? имел ли право самостоятельно закрыть дело без дополнительных экспертиз? куда обращаться, если следователь ошибается?

Суд мед экспертиза это и есть вскрытие (в данном конкретном случае). Если следователь пришел к выводу что гражданин повесился сам, то дело прекратить он может. Количество проведенных экспертиз тут роли не играет. Их нужно провести столько, сколько нужно для получения ясной картины события. Про прекращение дела п. 1 ч. 1 ст. 24 УПК РФ (за отсутствием события).
Обжаловать можно на выбор: руководителю следственного органа (начальнику следователя), прокурору (по данному району) либо в суд (см. ст. 124-125 УПК РФ)