Я не знаю, как надо. но могу предположить: в это отдельный предлог. Он употребляется и с другими словами. Например: В доме. Гнездо- это отдельное слово. В не является приставкой. В гнезде отвечает на вопрос ГДЕ? Так же есть метод проверки. Если между словом В и словом ГНЕЗДЕ можно поставить любое другое слово, то эти слова пишуться отдельно
в кулацком гнезде , например.