Какой корень у слова подоконник с доказательствами (какие слова для проверки)

Корень окон, оконце окно.

ПодОКОНник
Окно- полностью корень, однокоренные слова: оконный, окошко (тут корень -окош-, из-за чередования согласных).
Добавляем приставку -под- и суффикс -ник- получается слово -подоконник-

Если надо то вот слова с приставкой: подставка, поддержать, подъезд и с суффиксом: всадник, будильник, холодильник