Птицы,по-видимому,зябли на снегу,и поэтому сбились в одну как можно объяснить постановку

по видимому - это вводное слово (они всегда в запятых)

 запятая перед И разделяет простые предложения в составе сложного

Первые две запятые это обрамляется вводное слово. По правилу вводные слова всегда выделяются запятыми. 

Насчет 3 запятой не уверен нужна ли она вообще здесь