Комбинативная изменчивость основывается на возникновении новых комбинаций генов родителей. При комбинативной изменчивости в результате слияния родительских гамет возникают новые комбинации генов, однако сами гены и хромосомы остаются неизменными (пример: каждый новый организм является новый комбинацией генов родителей) . Механизмы комбинативной изменчивости: 1) независимое расхождение хромосом в анафазу І мейоза. 2) Кроссенговер 3) Случайное слияние гамет 4) Случайный подбор родительских пар Комбинативная изменчивость возникает при половом процессе в результате новых сочетаний генов, возникающих при оплодотворении, кроссинговере, конъюгации т. е. при процессах, сопровождающихся рекомбинациями (перераспределением и новыми сочетаниями) генов. В результате комбинативной изменчивости возникают организмы, отличающиеся от своих родителей по генотипам и фенотипам. Некоторые комбинативные изменения могут быть вредны для отдельной особи. Для вида же комбинативные изменения, в целом, полезны, т. к. ведут к генотипическому и фенотипическому разнообразию. Это выживанию видов и их эволюционному прогрессу.
Велика роль простейших в формировании коры нашей планеты. В Мировом океане в несметных количествах обитают простейшие, имеющие минеральный скелет (известковый, кремниевый и др.), которые после отмирания осаждаются на дно, образуя многометровые толщи илов. Когда в результате тектонических процессов дно океана становится сушей, донные отложения преобразуются в осадочные породы и образуют основную массу поверхностных слоев земной коры: известняки, мел, мрамор. Принимая участие в создании облика нашей планеты, простейшие оказываются важным звеном в круговороте многих элементов Земли: кальция, кремния, магния, стронция. Эта сторона деятельности простейших была убедительно показана основателем учения о биосфере академиком В. И. Вернадским (1863-1945).