В клетке находится одно ядро, окруженное ядерной оболочкой. В цитоплазме находится множество хроматофоров, содержащих нужные для фотосинтеза хлорофилл. Эвглена имеет в своей жизнедеятельности черты как растений, так и животных. Она питается автотрофно, осуществляет процесс фотосинтеза, что характерно для растений. Как животное эвглена активно двигается и питается гетеротрофным способом — поедает мелких животных, одноклеточных водорослей.